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【關係樹】親緣關係樹:認識生命演化史的指南

【關係樹】親緣關係樹:認識生命演化史的指南


| **項目** | **説明** |
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| 樹狀圖 (演化樹) | 表示不同物種或個體之間親緣關係的樹形圖 |
| 系統發生學 (親緣演化學) | 研究個體親緣關係的學術領域 |
| 節點 | 演化樹中最末端的點(葉)或中間的點(中途點) |
| 根 | 演化樹的起始點,表示所有個體最接近的源頭 |
| 分支 | 各個節點連接的線段 |
| 二分點 (bifurcating nodes) | 有一個親源和恰好兩個子點的中途點 |
| 多分點 (multifurcating nodes) | 有超過兩個子點的中途點 |
| 有根樹 | 具有根節點的演化樹 |
| 無根樹 | 不具有根節點的演化樹 |
| 準確解明的樹 | 所有中途點都為二分點的演化樹 |
| 部分解明的樹 | 部分中途點為二分點,部分為多分點的演化樹 |
| 完全解明的樹 (二分樹) | 所有中途點都為二分點的演化樹 |
| 親緣羣 (共祖羣) | 可溯源至同一祖先的集羣 |
| 分支圖 (譜系樹) | 以分支表示相同性質物件的相對關係的圖表 |
| 分類操作單元 (OTU) | 所要研究的物種或類階 |
| 內羣 | 要研究的物種 |
| 外羣 | 具有「定錨作用」的參考物種 |
| 枝條 | 連接 OTU 或節點的線段 |
| 端點枝條 | 連接 OTU 的枝條 |
| 中間枝條 | 連接節點的枝條 |
| 節點 | 代表衍生出 OTU 的共同祖先的點 |
| 枝條長度 | 沒有時間軸的情況下,代表改變的程度;有時間軸的情況下,代表物種分化後各自的演化時間 |
| 錯誤的陷阱 | 1. 認為有主枝和旁枝 2. 認為排列愈靠近的物種親緣關係愈接近 3. 認為有最原始的物種 |

關係樹

簡介

關係樹是一種可視化的數據結構,它用於表示關係和關聯中的對象。它通過節點和邊緣組成,其中節點代表實體,而邊緣表示它們之間的關聯。

關係樹 Play

關係樹的類型

不同的關係樹有不同的用途和表現形式:

關係樹

樹型 特徵
層次樹 有組織的樹形結構,其中每個節點最多與一個父節點相連。
網絡樹 節點之間可以存在多個邊緣。
星形樹 所有節點都直接連接到單個根節點。
環狀樹 節點通過單向或雙向邊緣連接,形成環狀結構。

應用

關係樹可用於建模各種關係和數據結構,例如:

  • 家譜
  • 組織圖
  • 社交網絡
  • 分類法

建立關係樹

建立關係樹時,需要考慮以下步驟:

  • 定義節點:識別要包含在關係樹中的實體。
  • 建立邊緣:確定實體之間的關聯並用邊緣表示。
  • 指定權重:(可選)如果需要,可以將權重分配給邊緣以表示關聯的強度。
  • 選擇合適的樹型:根據數據的結構和用例選擇最合適的關係樹類型。

分析關係樹

一旦建立了關係樹,就可以執行以下分析操作:

  • 查找關係:確定不同實體之間的關係。
  • 確定階層:在層次樹中找出父節點和子節點。
  • 計算中心度:評估節點在樹中的重要性和連通性。
  • 發現模式:識別樹中的模式、羣組和異常值。

關係樹的優缺點

優點:

  • 直觀的視覺化方式
  • 輕鬆表達複雜的關係
  • 便於分析和發現模式

缺點:

  • 可能難以維護大型關係樹
  • 在表示具有多重關聯的數據時可能不夠靈活
  • 隨著關係發生變化,需要持續更新

結論

關係樹是一種強大的數據結構,可視化地表示關係和關聯。通過選擇合適的類型並仔細構建,企業和組織可以有效地管理和分析複雜的數據集,從而深入瞭解其結構和關係。