不管你是專題生是研究生，本文提供即加入有機化學實驗室同學們，瞭解做有機化學實驗相關流程，有些基礎概念，後進入實驗室能上手。
本文內容是敍述我們做方法學實驗室流程、習慣，加上一些筆者經驗談，其他實驗室有流程及習慣，故同學們是要你們實驗室所教內容主，但我相信基本上有機實驗要做流程離不開這些，説流程：(6)測NMR，確認產物結構＊萃取、純化、NMR部分敍述大致上流程，深入技巧會另外寫文章探討。
而以下是六項流程詳説，並添加一些筆者認為應該注意事項：每一次下反應要寫實驗紀錄簿，寫實驗紀錄簿目的於：＊記錄你操作手法及流程是，有些化學反應不是將起始物全部丟進反應瓶，加溶劑攪一攪可以鬆。
(4)抽真空：確保我們反應會外界空氣幹擾，秤完藥後反應瓶拿去抽真空，抽完用血清塞塞後插上氮氣球。
因此我們下反應流程記錄下來，後發現產率不如預期話，我們可以回過頭來查紀錄簿，看哪個流程需要改善，如果偷懶沒有紀錄話，很過一陣子忘了。
＊畫TLC片是重點之一，跑片狀況如何和什麼樣溶劑極性跑片要記錄下來，後如果要做同樣反應，回來，節省試跑TLC片時間。
2.下反應(流程，若paper步驟有需求調整)(2)選擇反應瓶：看需求，可以選擇寬口或口圓底瓶、底瓶、雙頸瓶、三頸瓶、壓管(封管實驗)，選好後磁石加入瓶中。
(3)秤藥：若藥物是，直接秤完加入反應瓶。
如果藥是未知密度液體，可反應瓶放到秤台上歸零，秤液體進去。
若是已知密度液體，算出該加多少量體積，後加完溶劑pipet或針筒打入反應瓶。
(4)抽真空：確保我們反應會外界空氣幹擾，秤完藥後反應瓶拿去抽真空，抽完用血清塞塞後插上氮氣球。
(6)加入液體藥物：如果paper沒有特別説，我會加完溶劑再加液體藥物，因為擔心秤藥階段，藥加完直接加液體藥反應開始了(有時會放熱，反應瓶會燙，擔心反應會掉)。
(7)開始反應：記錄簿上記錄開始反應時間，若是高温反應，反應放進油浴鍋後急著離開，認油浴鍋温度會浮動後離開(若你試新條件，反應一下50度，一下變80度，這個反應條件不準了)。
(8)追蹤反應：試新條件時，每隔一段時間點TLC片追蹤反應，觀察起始物消耗狀況，有沒有點產生。
追蹤一段時間後，發現起始物消耗完了，或起始物完全沒有動，或是起始物有消耗但過了一段時間沒有繼續消耗，可以收反應了。
＊若是冰在冰箱藥物，記得藥拿出來退冰後才可以打開。
如果沒有退冰打開，罐內藥物吸收空氣中水份而掉。
＊假設今天二氯甲烷萃取，若反應溶劑是二氯甲烷以外有機溶劑，要拿去迴縮機溶劑抽乾後才能進行萃取，否則有可能會出現有機層和水層難以分層情況。
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(1)點TLC片，確認反應結束後，記錄總反應時間及顏色變化，並TLC片狀況畫記錄簿上(話可以用貼)。
(2)我們實驗室例，大部分乙醚、乙酸乙酯(EA)或二氯甲烷(DCM)萃取。
(3)萃取時有機層和水層量，比例抓1：1。
(有些paper會告訴你多少有機溶劑和水去萃取)(4)萃取完後，收集有機層部分，裡面會有一些微量水萃掉，加入硫酸鎂水，鋪濾紙漏斗上，將濾液過濾到一個乾瓶子中，得到一瓶完全無水有機溶液(水沒除乾話，流column時化合物會卡column)，會加入酸性、鹼性或中性和水溶液萃取兩次，第三次加入和食鹽水萃取。
(5)利用迴縮機，多餘有機溶劑抽乾，抽乾後化合物轉移至底瓶。
(6)一次TLC片，確認萃取完TLC片狀況，二度TLC片狀況畫記錄簿上。
＊假設今天二氯甲烷萃取，若反應溶劑是二氯甲烷以外有機溶劑，要拿去迴縮機溶劑抽乾後才能進行萃取，否則有可能會出現有機層和水層難以分層情況。
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是當反應用溶劑是醇類(甲醇、乙醇……)時，如果萃取前上濃縮機抽乾，萃取時醇類會所有有機物溶進水層。
＊來説有機溶劑密度水小，故萃取時溶液收集上層。
要注意是二氯甲烷密度比水大，二氯甲烷萃取話要取下層。
＊有時萃取會發生有機層和水層乳化分層現象，不想等待一段靜置時間話，加入和食鹽水可以消除乳化現象。
＊上述第四點會説加入和食鹽水進行第三次萃取原因是，和食鹽水可以消除乳化現象，讓有機層和水層分層，這時小心操作漏掉水層，收集到有機層水量會，下一步不用加入多硫酸鎂水，因為有時加入多硫酸鎂水造成目標化合物卡硫酸鎂中。
＊萃取時有機層和水層量比例加1：1，若有機層溶液加太少，你目標化合物有機會溶到水層去。
(1)流column前，要試著溶劑搭配或溶劑比例來跑TLC片，測試哪一種跑液適合拿來沖提column(理想狀況是，目標產物點RF值0.3位置)。
(2)Packing column，可用馬達加壓來加速，沒話可以用搖，讓silica gel和溶劑。
(3)Loading化合物到column中，結束後可加一些海砂(加入一公分高度)，防止倒沖提液進去後，silica gel和化合物沖起。